Sopra i mille metri si sviluppa una ampia pineta che fa da cuscino tra il Vettore e la la terra. La pineta è accompagnata da faggi, aceri montani, tassi e agrifogli. In alta quota, dominano i cespugli di ginepro.

La flora è ricca e interessante; numerose sono le specie che colonizzano la vallata pretarese, le rocce dei rilievi, le rive degli specchi d'acqua. Tra queste il giglio martagone, l'uva orsina; più comuni la genziana e la peonia, mentre endemiche sono il genepì dell'Appennino e la rara stella alpina appenninica, presente sul monte Vettore.

La fauna presenta molte specie interessanti. Estinti l'orso e la lontra, restano la volpe, il ghiro, il tasso, la faina e la martora, numerose specie di roditori, arvicole, insettivori e pipistrelli. Presenti anche l'istrice e il capriolo. Più rare sono il gatto selvatico e soprattutto il lupo. Negli ultimi anni è presente, in maniera massiccia ed invasiva, il cinghiale che crea numerosi danni alle coltivazioni della popolazione autoctona.

Numerosi gli uccelli: gracchio corallino ed alpino, fringuello alpino, picchio muraiolo, cotornice, pernice, quaglie, fagiani, cardellino, merlo locale, tortore, pettirosso, cuculo, corvo imperiale e tra i rapaci anche specie rare come il falco pellegrino, il gufo relae e l'astore. E' inoltre possibile vedere l'aquila reale che qui è presente in diversi esemplari.

Tra i rettili ci sono la vipera Orsini e la coronnella austriaca; tra gli anfibi la salamandra pezzata e la salamandrina dagli occhiali.

La zona di Pretare e del monte Vettore sono ricche di farfalle presenti in circa un migliaio di specie diverse. tra cui il grosso apollo e la polissena.

Ma l'animale più rappresentativo è il chirocefalo del Marchesini, un crostaceo che vive nel piccolo lago di Pilato, situato all'interno del monte Vettore, ed in nessun altro luogo al mondo.